Oddělení rostlinné virologie se zabývá výzkumem molekulárních patogenů rostlin - virů, fytoplazem a bakterií.
Viry- Zjišťování virů pomocí metod založených na detekci nukleové kyseliny a ELISA-testů
- Analýza a exprese virových genomů
- Studie molekulární variability a evoluce comovirů
- Vývoj nových molekulárních metod pro detekci virů - real-time PCR, mikročipy (microarrays)
- Hledání nových, dosud nepopsaných virů
- Množení virů v laboratorních hostitelských rostlinách
- Imunizace a příprava antisér proti přírodním i rekombinantním virovým proteinům
- Detekce fytoplayem pomocí PCR amplifikace 16S rRNA genu, RFLP analýzy, přenosu na barvínek, DAPI barvení a pozorování v elektronovém mikroskopu
- Vývoj nových molekulárních metod pro detekci fytoplazem - mikročipy (microarrays)
- Studie výskytu fytoplazem a jejich variability
- Hledání a analýza genomů fytoplazmových plazmidů
