Oddělení fotosyntézy studuje molekulární mechanizmy primárních procesů absorbce světla a energetické přeměny, strukturu proteinových komplexů fotosyntetických pigmentů a interakci rostlin s jejich prostředím při regulaci výměny plynů a fixaci CO2.

• Izolace reakčních center fotosystému II
• Lokalizace primárních pigmentů fotosystému II
• Výzkum alternativních dárců elektronů a procesů, které chrání reakční centrum během nadměrného ozáření
• Analýza procesů na fotosyntetické membráně růžových (purple) bakterií

• Výměna a vedení plynů v listech na úrovni stomat a mezofylu
• Charakteristika změn vodivosti v závislosti na koncentraci okolního CO2

• Metody založené na transmisní elektronové mikroskopii a metodě "single particle averaging"
• Vztahy mezi strukturou a funkcí fotosyntetického aparátu u různých rostlin, řas a bakterií